Boletins de notícias LNCC
O LNCC Notícias é um boletim digital online, de acesso público e periodicidade mensal, para divulgar as atividades e notícias do Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC/MCTIC). A reprodução parcial ou total das notas é autorizada, desde que acompanhada das devidas referências e créditos da publicação, indicando o link para a página.
O Diretor do LNCC, Augusto Gadelha, compôs a comitiva do Ministro da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações, Gilberto Kassab, que participou do Terceiro Diálogo de Alto Nível Indústria-Ciência-Governo realizada nos dias 7 e 8 de maio na cidade de Praia, em Cabo Verde.
Ministro da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações, Gilberto Kassab, com a delegação brasileira em frente à Biblioteca Nacional da cidade de Praia (Cabo Verde). Foto: Ascom/MCTIC
A abertura contou com a presença do Presidente de Cabo Verde, Jorge Carlos Fonseca, além de ministros e secretários nacionais de Portugal, Brasil, São Tomé e Príncipe, Angola, África do Sul, Espanha, Nigéria e Açores, onde foram discutidas, com a participação de cientistas desses e de outros países, como EUA e Noruega, iniciativas de implementação do Atlantic International Research Centre (AIR Centre).
O AIR Centre é uma iniciativa multilateral proposta pelo Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior de Portugal com a co-liderança do Brasil. A ideia deste Centro tem como premissa a cooperação técnico-científica nas áreas de oceanos, espaço, big data e mudanças climáticas.
O Diretor do LNCC apresentou palestra sobre Scientific Infrastructure for Big Data, onde mostrou a competência do Brasil nesta área e a possibilidade de uso do centro de supercomputação do LNCC e do SINAPAD, apontando exigências especificas de recursos humanos e de infraestrutura para o tratamento de dados em larga escala a serem gerados nos projetos do AIR Centre.
Diretor do LNCC, Augusto Gadelha, ministra palestra no Terceiro Diálogo de Alto Nível Indústria-Ciência-Governo (Cabo Verde) Foto: Ascom/MCTIC
Na ocasião, o Diretor do INPE, Ricardo Galvão e o Diretor do MCTIC, Andrei Polejack, também ministraram palestras.
Saiba mais sobre o SINAPAD:
O LNCC coordena o Sistema Nacional de Processamento de Alto Desempenho (SINAPAD) que é uma rede de centros de computação de alto desempenho, geograficamente distribuídos, instituída pelo MCTIC. São nove unidades, denominadas "Centros Nacionais de Processamento de Alto Desempenho" (CENAPADs), operadas respectivamente pela UFRGS, UFMG, UFC, UNICAMP, UFRJ, UFPE, INPE, INPA e LNCC.
O LNCC realiza, entre os dias 1º e 10 de agosto, a Escola de Inverno Supercomputador Santos Dumont 2018, que tem como objetivo principal prover à comunidade de usuários do Sdumont minicursos sobre ferramentas de perfilagem, modelos de programação e linguagens para o desenvolvimento de algoritmos paralelos otimizados, onde o usuário venha a utilizar os recursos computacionais do SDumont de forma mais eficiente e, consequentemente, obter menor tempo de execução nas suas aplicações. De forma a fomentar a formação de recursos humanos na área de Computação de Alto desempenho, pretende-se permitir também a participação de profissionais da área de computação que desejam aprender técnicas de desenvolvimento de programas paralelos.
A programação conta com os minicursos Introdução ao Lunix para Processamento de Alto Desempenho, C para Programação Paralela, Fortram para Programação Paralela, Introdução ao ambiente SDUMONT /SLURM e Ferramentas BULLX-DE, Fundamentals of Deep Learning For Computer Vision: An Introduction, Introdução à E/S Paralela no SDUMONT, Introdução à Programação CUDA, Introdução ao uso de containers em Computação de Alto desempenho, Introdução à Programação Paralela de Aceleradores em OpenCL, Introdução à Programação em Aceleradores com Diretivas, Introdução a Programação com MPI, Introdução à Intel Parallel Studio XE, Introdução a Programação MPI com Extensões para E/S (MPI-IO), Introdução a Programação Paralela/ OpenMP e R em ambiente HPC, que acontecem nos horários de 08h30 ás 17h30, com horário de almoço entre 12h30 às 13h30.
A organização do evento encerrará as inscrições dos minicursos quando atingir o número máximo de 40 pessoas por minicurso.
O valor da inscrição é de R$ 60,00 com direito a escolha de 5 minicursos.
Para se inscrever, acesse aqui.
Pesquisadores do LNCC participaram do Simpósio Brasileiro de Redes de Computadores e Sistemas Distribuídos (SBRC), no período de 6 a 10 de maio, em Campos do Jordão (São Paulo).
Os pesquisadores do LNCC, Antônio Tadeu, Artur Ziviani e Bruno Schulze, fizeram parte do Comitê de Programa do SBRC. Esse é um evento anual promovido pela Sociedade Brasileira de Computação (SBC) e pelo Laboratório de Redes de Computadores (LARC). Ao longo de mais de três décadas de realização, o SBRC firmou-se como o mais importante evento científico nacional em redes de computadores e sistemas distribuídos, e um dos mais concorridos em informática.
Bruno Schulze, a bolsista de pós-doutorado do LNCC Mariza Ferro e Tiago Ferreto (PUC-RS) formaram o grupo de Co-Presidentes do XVI Workshop de Computação em Clouds e Aplicações (WCGA 2018). Esse workshop, realizado em conjunto com o SBRC, contou com 11 artigos completos para publicação e apresentação oral nas áreas de infraestrutura virtualizada, serviços e aplicações, relacionados aos temas de elasticidade de aplicações, alocação de máquinas virtuais, eficiência energética, migração entre nuvens, entre outros.
Antônio Tadeu no estande do projeto HPC4e
Antônio Tadeu representou o projeto HPC4e durante o Workshop da Rede Nacional de Ensino e Pesquisa (WRNP) que ocorre todo ano junto ao SBRC, bem como apresentou o trabalho de doutorado de seu aluno Franklin Zillmer intitulado Avaliação de desempenho de um simulador numérico distribuído e tolerante a falhas baseado no modelo de atores no WCGA.
Artur Ziviani, pesquisador do LNCC, apresenta minicurso durante o SBRC
Foto: SBRC
Artur Ziviani apresentou um minicurso intitulado Humanos no ciclo de comunicação: facilitadores das redes de próxima geração em conjunto com Rafael Lima Costa (INRIA Saclay e UFBA), Leobino Sampaio (UFBA), e Aline Carneiro Viana (INRIA Saclay). Também organizou a reunião do Comitê Técnico de Monitoramento de Redes (CT-Mon) da RNP, do qual é coordenador desde 2014. Participou ainda como debatedor convidado de um painel realizado no workshop da RNP sobre dados abertos de pesquisa na área de redes de computadores. Ziviani foi premiado junto com a aluna de mestrado Juliana Mascarenhas pelo melhor artigo publicado no WBlockchain 2018, intitulado "Análise da Rede de Transações do Ethereum", e também recebeu menção honrosa pelo artigo Arquitetura de Provisão de Qualidade de Serviço para Aplicações Distribuídas de Alto Desempenho em Redes Definidas por Software" (publicado no WGRS 2018). Os trabalhos foram realizados em parceria com colaboradores da Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF/MG).
O LNCC recebeu, nos dias 8 e 9 de maio, representantes da Universidade do Vale do Rio dos Sinos (UNISINOS) e do Centro de Pesquisa da Petrobras (CENPES) para dar início às atividades previstas em um projeto de cooperação cientifica nas áreas de modelagem computacional geológica e matemática de reservatórios de petróleo e gás denominado VISCARB - Atlas Digital Interativo com Visualização 3D de Análogos em Várias Escalas e Modelagem Multiescala.
Foto: Camila Tavares
O projeto de pesquisa tem como foco o estudo e modelagem de formações geológicas com presença de fraturas e cavernas típicas dos reservatórios de petróleo e gás do pré-sal brasileiro.
O LNCC, através do grupo COMOHR (Computational Modeling of Hydrocarbon Reservoirs Group), desenvolve o papel de modelagem multiescala e desenvolvimento de métodos de simulação numérica de escoamentos e geomecânica de meios porosos típicos dessas regiões estudadas. Os resultados são propriedades petrofísicas equivalentes para sub-regiões que poderão ser usadas em simuladores de reservatórios.
O Diretor do LNCC, Augusto Gadelha, chefiou a delegação brasileira na Segunda Reunião Plenária do Grupo de Trabalho de Computação de Alto Desempenho dos BRICS, realizada de 10 a 12 de abril, na cidade de Pune, na Índia.
Na ocasião, o Diretor do LNCC ministrou palestra sobre Current Trends and Roadmap of ICT and HPC in Brazil e propôs cinco áreas consideradas pelo Brasil como prioritárias para cooperação entre os países do BRICS: saúde (doenças negligenciadas: vírus Zika, febre amarela, entre outras); energia (não renováveis, novas e renováveis); proteínas (fármacos, estrutura de proteínas); clima (previsão do tempo, poluição, mudanças climáticas, aplicação em agricultura); populações, migrações e seus impactos econômicos (simulação de movimentos migratórios).
Gadelha mencionou também o interesse nos tópicos de Inteligência Artificial (Machine Learning e Deep Learning); Big Data e Analystics em aplicações em Agricultura, Meio Ambiente e Estudos Sociais; IoT (Internet of Things) sensores, redes, cidades inteligentes, controle de pragas e zoonoses; Segurança Cibernética e Manufatura Inteligente.
Delegação brasileira na reunião em Pune, India, em companhia do coordenador/ anfitrião do evento Dr. Sanjay Wandhekar, Diretor Associado do Center for Development of Advanced Computing (CDAC) da India (segundo da direita para a esquerda). Diretor do LNCC, Augusto Gadelha, primeiro da esquerda para a direita na foto.
A delegação brasileira, composta pelo Dr. Gadelha, Prof. Philippe O. A. Navaux, da UFRGS, Dr. Victor Mammana, diretor do CTI-Renato Archer, e Dr. Jairo Panetta, do ITA, visitou duas empresas de TI em Pune, KPIT e Tech Mahindra, e também esteve no Centre of Development of Advanced Computing (C-DAC), no Campus da S.P. Pune University, vinculado ao Ministry of Electronics and Information Technology (Meit) do Governo da Índia.
Os resultados dessa reunião devem ser avaliados pelos responsáveis pela elaboração das próximas chamadas públicas conjuntas do BRICS.
No período de 15 a 17 de maio, o evento Pint Of Science Festival atraiu um grande público, em 56 cidades de todo o Brasil, em torno de diversos temas tratados em cerca de 500 bate-papos com pesquisadores de diferentes instituições, entre elas dois pesquisadores do LNCC, Ana Tereza Vasconcelos e Artur Ziviani.
No primeiro dia do evento, no Bar Teto Solar (RJ), Ana Tereza Vasconcelos, coordenadora do Laboratório de Bioinformática e da Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida, ambos do LNCC, falou sobre A Nova Ferramenta de Edição Genética, intitulada CRISPR/Cas9, um mecanismo de defesa antigo e natural encontrado inicialmente em diversas bactérias, que além de ser uma ferramenta de edição de genoma poderia, por exemplo, ser usado para introduzir genes que podem lentamente matar os mosquitos que transmitem malária.
No dia 17 de maio, no bar Na Garganta Cultura Pub, em Juiz de Fora (MG), Artur Ziviani participou de bate-papo sobre Tecnologia, pra que te quero? e falou sobre os impactos da ciência de dados na sociedade.
Para mais informações sobre o evento em geral, acesse aqui.
A mestranda em Modelagem Computacional do LNCC, Ana Luiza Karl, recebeu o prêmio de Jovem Cientista, do Lions Clube Petrópolis, no dia 19 de maio, no campus da Faculdade Arthur Sá Earp Neto - Faculdade de Medicina de Petrópolis (FASE/ FMP). Anualmente, o Lions Clube de Petrópolis realiza uma homenagem a personalidades, empresas e entidades, em diferentes áreas de atuação.
Ana Luíza foi indicada para receber a premiação por sua pesquisa sobre Modelagem Molecular de Inibidores Potentes e Seletivos para a Enzima Acetilcolinesterase" que, com orientação do pesquisador do LNCC, Laurent Dardenne, e coorientação da pós-doutoranda do LNCC, Isabella Alvim Guedes, utilizou em seu trabalho ferramentas de atracamento molecular proteína-ligante para o planejamento de inibidores da enzima acetilcolinesterase, considerada como importante alvo para o desenvolvimento de tratamento quimioterápico contra a doença de Alzheimer, com a colaboração de um grupo experimental do Instituto de Química da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS).
Em 2016, o trabalho ficou em segundo lugar nos destaques da Jornada de Iniciação Científica do LNCC, permitindo sua indicação e premiação ao Destaque na Iniciação Científica e Tecnológica do CNPq 2016, na categoria de Ciências da Vida, e recebeu, em 2017, o 14º Prêmio de Destaque na Iniciação Científica e Tecnológica do CNPq, também na categoria Ciências da Vida.
Os resultados da pesquisa viabilizaram o depósito de uma patente nacional e outra internacional (colaboração LNCC e IQ/UFRGS), além da publicação de dois artigos em periódicos: European Journal of Medicinal Chemistry, em 2016; e Journal of Brazilian Chemical Society, em 2017.
O estudo é de grande relevância, pelo fato do grupo experimental possuir dados in vitro da potência e seletividade desses inibidores, porém, não ter informações sobre como interagiam com seu receptor biológico (acetilcolinesterase). E, uma vez que os métodos experimentais para a obtenção do modo de ligação possuem alto custo econômico e de tempo, ferramentas da modelagem molecular puderam ser utilizadas no intuito de tentar prever a formação do complexo acetilcolinesterase e os inibidores, bem como as principais características dessa interação.
Estão abertas as inscrições para a IX Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (IX EMMSB) que acontece entre os dias 20 a 24 de agosto de 2018, na sede do Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC/MCTIC), em Petrópolis/RJ.
O evento é organizado pelo LNCC, pela Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF) e pelo Departamento de Ciência da Computação UFJF.
A nona edição do evento conta com a participação de alunos e pesquisadores interessados em áreas relacionadas à modelagem molecular computacional, dinâmica molecular, modelagem molecular aplicada ao desenvolvimento de fármacos, metodologias de docking receptor-ligante, métodos de aprendizagem de máquina e cálculos estocásticos e quânticos sobre biomoléculas. Serão ministradas 24 palestras e oferecidos 9 minicursos práticos.
O PRAZO PARA INSCRIÇÃO ENCERRA NO DIA 29 DE JUNHO. São oferecidas 180 vagas para as aulas teóricas (palestras) e 120 vagas para as aulas práticas. A seleção dos pré-inscritos terá a seguinte ordem de prioridade: alunos de pós-graduação, alunos de graduação, pesquisadores-doutores. O resultado dos alunos selecionados para a IX EMMSB (inscrições, resumos aceitos, minicursos e apresentações orais) será divulgado na página inicial do evento, até o dia 06 de julho de 2018.
Confira a programação completa da IX EMMSB aqui.
Fábio Borges de Oliveira
Wagner Léo
Sérgio Ferreira de Figueiredo - Coordenador
Matheus B. de Mendonça
Coordenação de Tecnologia da Informação e Comunicação - COTIC
Serviço de Suporte de Sistemas e Redes
Lígia Morais - Coordenadora do SECIN
Tathiana Tapajós, Graziele Soares - Equipe SECIN
Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Sala 2D10
Av. Getúlio Vargas, 333 - Quitandinha
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