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Programas Institucionais
Algoritmos Quânticos e Híbridos
Apoio computacional ao desenvolvimento científico em larga escala, Universal 14/2011 - R$ 144.000,00
Apoio à manutenção da infraestrutura do centro multiusuário Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida (UGCDFA).
Bioinformática aplicada ás análises de sequências transcriptômicas de Klebsiella pneumoniae.
Caracterização de pequenos RNAs (menor que 50 nucleotídeos) em Infecção Óssea Conjunta induzidas por Staphylococcus aureus
CENAPAD - Centro de Processamento de Alto Desempenho
Construção da pipeline Turdus para busca e caracterização de elementos transponíveis em eucariotos
Curso do Centro Brasil-Argentino de Biotecnologia: Ferramentas de bioinformática para análise de dados RNA-seq
Cyberenvironments
Genômica comparada de ostras de importância econômica do gênero Crassostrea: caracterização de elementos móveis e mito-filogenômica.
Gerenciamento e Análise de Dados Biológicos em Plataformas de Computação de Alto Desempenho (HPC) e de Processamento de Grandes Massas de Dados (Big Data)
Identificação de transcritos relacionados à resistência da seringueira Hevea brasiliensis ao patógeno Microcyclus ulei utilizando dados de RNA-Seq e mineração de dados.
Incubadora de Empresas
Laboratório de Bioinformática
Medicina de precisão aplicada à imunodeficiência primária (PIDD): Uma abordagem progressiva e custo-efetiva utilizando o sequenciamento de nova geração.
Modelagem Computacional de Reservatórios de Petroleo e Águas Subterrâneas
Métodos Estocásticos em Finanças
Nuvens Computacionais Privadas para o Desenvolvimento e Suporte de Aplicações Científicas e Tecnológicas
PIBIC/LNCC - Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica
PIBITI/LNCC - Programa Institucional de Bolsas de Iniciação em Desenvolvimento Tecnológico e Inovação
Plataforma Computacional Multiusuária para Análises de Bioinformática em Larga Escala, no Apoio à Rede Nacional Estruturante de Bioinformática
POP-RJ - Ponto de Presença da RNP
PRH 50 - Modelagem Computacional Hidro-Geomecânica de Reservatório Não-Convencionais
Programa de Capacitação Institucional - LNCC/MCTI - 2015-2017
Rede Brasileira de Bioinformática
SINAPAD
Sistemas Dinâmicos Dissipativos, Controle Ótimo e Aplicações
Visualização Científica e Segmentação de Imagens Aplicadas à Hemodinâmica Computacional
Projetos de Cooperação Bilateral
Acordo de Cooperação entre o LNCC, Institut Pasteur Paris e USP - TvivaxDiag
A Global Alliance For Zika Virus Control And Prevention - ZIKAlliance
Convenio com a Universidade de Bologna (Itália)
Convenio com a Universidade de Brescia (Itália)
Convenio com a Universidade del Bio Bio (Chile)
Convenio com a Universidade Nacional de Ingenieria (Lima-Perú)
Convênio com a Universidade de Concepión
Convênio com o Politécnico de Milão (Itália)
HOMAR -- High performance Multiscale Algorithms for wave pRopagation problems (Edital Cooperação Internacional FAPERJ/INRIA 2014)
Laminin and Cell Therapy for Muscular Dystrophies
LIA (Laboratório Internacional Associado): Laboratório InteRnacional de pesquisa em bIOinformática - LIRIO
Metagenômica aplicada à avaliação dos efeitos da injeção de CO2 na microbiota de reservatórios - Petrogal
Modelagem de Incertezas em Problemas de Fenômenos de Transporte
MUSIC - Gerência de dados científicos em uma nuvem multi-site
Projetos em Colaboração com outras Instituições.
Acordo de Cooperação entre o LNCC, Institut Pasteur Paris e USP - TvivaxDiag
Ampliação e Modernização dos Laboratórios de Bioinformática e Medicina Assistida - AMLBIOHEMO
Analyzing the Computational Performance of Quantum Walk Based Algorithms on Structured Graphs
Aplicação do Protocolo RADNET em plataformas computacionais de Alta Disponibilidade e de Missão Crítica e de segurança de dados
Apoio computacional ao desenvolvimento científico em larga escala, Universal 14/2011 - R$ 144.000,00
Apoio à manutenção da infraestrutura do centro multiusuário Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida (UGCDFA).
Avaliação de desempenho dos Relógios de Sistema RVEC e HPGC
BioMiningHPC: Arquitetura baseada em Workflows, Mineração e Proveniência de Dados de Experimentos de Bioinformática para Ambientes HPC no Apoio ao Estudo de Doenças Negligenciadas e Doenças Genômicas Raras em Humanos, APQ1_2015/2
Caracterização de pequenos RNAs (menor que 50 nucleotídeos) em Infecção Óssea Conjunta induzidas por Staphylococcus aureus
CICN - Centro de Inovação em Computação em Nuvem
Cyberenvironments
Desafios da Computação Científica em Nuvem
Desenvolvimento de funcionalidades, aumento da escalabilidade e estudos numéricos com modelos atmosféricos de alta resolução: BRAMS e OLAM
Desenvolvimento de Métodos Computacionais Aplicados ao Desenho racional de Fármacos e Predição de Estrutura de Proteínas.
Estudo Molecular das Doenças Genéticas Crônicas: Defeitos Congênitos, Doença do Desenvolvimento e Câncer Infantil, a partir da Via das RASopatias.
Gerência e Analise de Grandes Volumes de Dados Científicos
HPC4E - High-Performance Computing for Energy
Laminin and Cell Therapy for Muscular Dystrophies
Medicina de precisão aplicada à imunodeficiência primária (PIDD): Uma abordagem progressiva e custo-efetiva utilizando o sequenciamento de nova geração.
Metagenômica aplicada à avaliação dos efeitos da injeção de CO2 na microbiota de reservatórios - Petrogal
Múltiplos Mini Veículos Aéreos Não Tripulados em Vôos Colaborativos
Modelagem Computacional em Sistemas Sócio-Educacionais
SubProjetos:
- Sistema Escola Inteligente
Modelo de Uso de Nuvem Computacional Privada em Apoio ao Desenvolvimento de Aplicações Médicas
NITRio - Núcleo de Inovação Tecnológica
Pesquisa Ecológica de Longa Duração - Guanabara
Pesquisa e desenvolvimento de otimizações e modernização de código para métodos numéricos de diferenças finitas para solução de equações diferenciais parciais em arquiteturas paralelas híbridas
Plasticidade Genômica, Mobiloma e Evolução do Patógeno Humano Vibrio Cholerae e Vibrios Ambientais.
Processos adaptativos em Staphylococcus aureus em dois diferentes niveis: Evolução populacional do clone USA400 e mudança para o estado de persistência durante infecção osteo-articular.
Prospecção e priorização de alvos moleculares para o desenho de novos fármacos contra Klebsiella pneumoniae e Mycobacterium tuberculosis utilizando técnicas de bioinformática
Rede 4 - Microcefalia associada à infecção pelo vírus Zika: uma abordagem transdisciplinar
Rede Avançada de Pesquisa em Biotecnologia Marinha
Rede Avançada em Biologia Computacional (RABICÓ)
Rede Brasileira de Bioinformática
Rede Brasileira de Visualização
SciCumulus2 - Infraestrutura Computacional para Execução de Experimentos Científicos em Nuvens de Computadores, Universal CNPq
Simulação Numérica de Escoamentos Multifásicos em Carbonatos Heterogêneos Incorporando Assimilação de Dados e Acoplamento Geomecânico Com as Rochas Adjacentes: Aplicação ao Pré-Sal - Rede Siger (Similação e Gerenciamento de Reservatórios).
Sistema de Microscopia de Óptica Não-Linear Multifotônica: Introdução de um Novo Recurso na Plataforma de Bioimagem da Fundação Oswaldo Cruz.
UDELAR: Análise da Termodinâmica de Passeios Quânticos e Aplicações em Algoritmos de Busca
Windows Azure for Research Proposal: User-Steering Phylogenetic Workflows in the Cloud
Projetos Integrados de Pesquisa
Apoio computacional ao desenvolvimento científico em larga escala, Universal 14/2011 - R$ 144.000,00
Estudo Molecular das Doenças Genéticas Crônicas: Defeitos Congênitos, Doença do Desenvolvimento e Câncer Infantil, a partir da Via das RASopatias.
Genômica Aplicada a Recursos Pesqueiros e de Aquicultura do Estado do Rio de Janeiro GARPA-RIO.
Genômica Computacional do Vírus da Zika (ZIKV) – GENOVIR
Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Medicina Assistida por Computação Científica (INCT-MACC)
LIA (Laboratório Internacional Associado): Laboratório InteRnacional de pesquisa em bIOinformática - LIRIO
Meta-heurística Bio-inspiradas: Meta-modelos e Computação de Alto Desempenho para Aplicações de Grande Porte.
Modelagem Computacional e Análise Numérica em Engenharias e Ciências Aplicadas
Multiscale hybrid mixed finite element methods for fluid flow in porous media and wave propagation models (FONDECYT #11140699)
Novos Métodos de Elementos Finitos: Formulação, Análise Numérica e Aplicações
Rede Avançada em Biologia Computacional (RABICÓ)
Robustez e Controle de Sistemas Estocásticos Incertos
SciCumulus2 - Infraestrutura Computacional para Execução de Experimentos Científicos em Nuvens de Computadores, Universal CNPq
Projetos 'Cientista do Nosso Estado'
Integração de grande quantidade de dados de redes biológicas: um portal de biologia de sistemas com ferramentas e bases de dados relacionadas às diversas ômicas para pré-processamento, mineração e divulgação de informações e conhecimento.
Modelagem Computacional Multiescala de Reservatórios Não Convencionais de Gás de Xisto
Projetos Individuais de Pesquisa
Bolsa de bancada Cientista Jovem do Nosso Estado. Edital FAPERJ 23/2013. Processo: E-26/102.177/2013 Análise de Sensibilidade Topológica: Teoria e Aplicações.
Bolsa Pesquisador Visitante Especial, PVE 2014. Edital MEC/MCTI/CAPES/CNPq/FAPS. Processo: 401206/2014-9. Análise de Sensibilidade Topológica: Teoria e Aplicações.
Bolsa Produtividade em Pesquisa MCT/CNPq, PQ-1C. Processo: 308352/2013-0. Análise de Sensibilidade Topológica: Teoria e Aplicações.
CiRTA: Ciência de Redes: Teoria e Aplicações
Computação Cientifica Distribuída de Alto Desempenho como Serviço
Controle de Sistemas Distribuídos
Estimação não invasiva de reserva de fluxo fracionado (FFR) a partir de imagens de tomografia computadorizada e simulação numérica de fenômenos hemodinâmicos
Filtragem e Controle de Classes de Sistemas Dinâmicos Não Lineares
Integração de grande quantidade de dados de redes biológicas: um portal de biologia de sistemas com ferramentas e bases de dados relacionadas às diversas ômicas para pré-processamento, mineração e divulgação de informações e conhecimento.
Metaheurísticas Inspiradas na Natureza
Metrologia e ciência de redes aplicadas à Internet
Mineração de Dados de Experimentos de Bioinformática Executados em Larga Escala no Apoio ao Estudo de Doenças Negligenciadas e Doenças Genômicas em Humanos
Organização e Informação em Biologia e Ecologia
SubProjetos:
- Organização de vias Metabólicas
- Organização Variavel em Sistemas Ecológicos
Reconstrução de modelos metabólicos integrados com redes regulatórias em genomas bacterianos