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Os portais científicos do SINAPAD permitem a execução, via interface Web, de aplicações científicas diversas nos clusters dos centros que compõem o sistema nacional. Segue abaixo uma lista dos portais atualmente disponíveis no sistema. Outros portais estão sendo desenvolvidos e serão anunciados em breve!!!
Se você tem interesse em usar um dos portais, envie uma mensagem para , informando o(s) portal(is) de interesse.
 
PORTAIS DISPONÍVEIS

Portal CAM-GRID

O portal CAM-GRID destina-se a permitir a execução do Community Atmosphere Model (CAM).
O CAM é considerado um modelo de escala global para simulações climáticas e seus resultados podem ser visualizados graficamente em softwares como o Integrated Data Viewer (IDV) e outros.

 

Portal BRAMS

O portal BRAMS-SINAPAD destina-se a permitir a execução do "Brazilian developments on the Regional Atmospheric Modelling System" (BRAMS). O BRAMS implementa um modelo de previsão numérica do tempo, tendo sido desenvolvido a partir do RAMS especificamente para os trópicos.

 

Portal ACES3

O portal ACES3 permite a execução do ACES III (Advanced Concepts in Electronic Structure III). ACES III é uma implementação paralela do software ACES, desenvolvido na Universidade da Flórida, para cálculo de estruturas eletrônicas em química quântica. Os algoritmos oferecidos pelo ACES III incluem: HF, SCF, MBPT(2) e CCSD(T). Para SCF, MBPT(2), e CCSD(T), funções de onda de referência HF restrita e irrestrita estão disponíveis. Para gradientes e Hessianas no nível MBPT(2), uma função de onda camada aberta HF restrita também está disponível. Os métodos são programados no ACES III por meio de uma linguagem chamada SIAL (Super Instruction Assembly Language). O Software foi projetado para uma otimização muito eficiente e fácil compatibilidade em diferentes arquiteturas de hardware.

 

Portal DANCE

Closeness Centrality é uma importante medida de centralidade em redes que classifica os nós pela sua proximidade com todos os demais nós na rede. A classificação de nós obtida por meio dessa centralidade permite que se identifique aqueles nós que estão melhor posicionados para realizar de forma eficiente processos de difusão, tais como difusão informações, distribuição de bens e epidemias. Infelizmente, o alto custo computacional envolvido no cálculo deste tipo de centralidade impede seu uso generalizado, em particular para as redes de larga escala. O Portal DANCE (Distributed Assessment of Network CEntrality) utiliza um algoritmo distribuído que fornece uma maneira rápida e eficiente para calcular uma classificação de nós fortemente correlacionada àquela obtida por meio de closeness centrality, permitindo assim a aplicação deste tipo de centralidade em análise de redes complexas de grande porte.

 

Portal Profrager

O portal ProFrager é uma ferramenta de geração de bibliotecas de fragmentos de proteínas. Os usuários podem escolher diversos parâmetros que alteram a composição das bibliotecas de maneira significativa. O ProFrager tem como diferencial oferecer ao usuário opções avançadas para a criação de suas bibliotecas, tais como, a criação de fragmentos exclusivamente a partir de estruturas homólogas (ou não homólogas) à sua sequência alvo, escolher entre diferentes bancos de proteínas não redundantes e selecionar a matriz de similaridade a ser utilizada. A geração dos fragmentos pode ainda ser refinada através da predição da estrutura secundária da sequência alvo.

 

Portal TrueRNG

Geradores de números verdadeiramente aleatórios utilizam sistemas físicos que obedecem leis probabilísticas. Essa característica contrasta com os geradores de números pseudo-aleatórios que usam sistemas físicos determinísticos mas cujo comportamento parece probabilístico devido à falta de conhecimento sobre os detalhes desses sistemas. Mecânica quântica é a única teoria física que obedece leis probabilísticas e não pode ser reduzida ou descrita em termos de uma teoria mais fundamental de natureza determinística. O portal TrueRNG explora um processo óptico quântico para gerar fluxos de bits verdadeiramente aleatórios. Contudo, é importante que os usuários tenham em mente que violações na aleatoriedade podem ocorrer devido a implementações imperfeitas de sistemas quânticos. Há testes que ajudam o usuário a ganhar confiança quanto à aleatoriedade dos números produzidos pelo gerador. Alguns desses testes podem ser verificados aqui.