Reconstrução de superfície, processamento de malhas de superfície, geração de malhas de volume, aplicação de condições de contorno e definição de propriedades da parede arterial e do sangue.

• Geração da (primeira) malha de superfície: Uma primeira aproximação da malha de superfície é gerada a partir da imagem aplicando o algoritmo de Marching Cubes sobre a imagem segmentada.

• Isolamento da primeira versão da superfície para extrair a região de interesse: Depois do processo de segmentação e reconstrução, é provável que existam regiões que não são de interesse na superfície e que, portanto, devem ser removidas. Para isto fornecem-se diversas ferramentas que permitem selecionar (por meio de clipes) a região na qual a simulação será realizada.

• Suavização da malha de superfície: As malhas obtidas a partir da primeira segmentação da imagem costumam ser de má qualidade e com quantidade insuficiente de triângulos para representar de maneira adequada a geometria. Para melhorar a qualidade destas malhas utilizam-se filtros de suavização que eliminam as componentes de alta freqüência, próprias dos métodos de reconstrução, presentes na malha de superfície.

• Processamento de malhas de elementos finitos: Visando obter resultados de elevada qualidade nas simulações numéricas, as malhas de elementos finitos devem ser refinadas e processadas. A eliminação de triângulos com forma de agulhas, a adição e remoção de nós assim como a suavização da malha constituem as ferramentas mais comuns no processo anterior à obtenção a versão final da malha de superfície.

• Geração de malhas de volume: A partir de uma malha de superfície de alta qualidade gera-se uma malha de volume utilizando o método Delaunay 3D, dando como resultado uma malha de tetraedros lineares. • Caracterização de propriedades e/ou condições de contorno: Para criar modelos de elementos finitos a partir das geometrias 3D dos vasos arteriais é preciso adicionar propriedades mecânicas à parede arterial, comportamento constitutivo ao sangue e também condições de contorno sobre toda a superfície que define a geometria. Diversas ferramentas para satisfazer estes requerimentos são fornecidos neste módulo.

• Simulação numérica: A resolução numérica dos modelos matemáticos é realizada de empregando o Método dos Elementos Finitos. Aqui, todos os aspectos envolvidos na formulação do problema podem ser manipulados convenientemente através de diversas janelas de comando.