Produção Técnico-Científica - LNCC em 2019


PRODUÇÃO CIENTÍFICA



ATIVIDADES CIENTÍFICAS

Desenvolvimento de Softwares:

de Vasconcelos, A. T. R. , Galheigo, M., Bastos, B. F., Gomes, A. T. A.; 'Bioinfo-Portal: The Scientific Gateway for Integrating Bioinformatics in the Brazilian High-Performance Computing Network'; Data Início: 01/01/2017

Gadelha Jr., L. M. R., Meirelles, P. M., Albuquerque, M. M. R., Ribeiro, M. L., Thompson, F.; 'BaMBa - Brazilian Marine Biodiversity Database'; Data Início: 01/07/2014

Gomes, A. T. A., Valentin, F., Concha, D. F. P., Pereira, W. S.; 'MHM Solver: simulador de elementos finitos multiescala'; Linux; Simulador de elementos finitos multiescala baseado no método MHM; HPC; Data Início: 04/02/2014

Sanchez-Tapia, A., Lima, R. O., Barros, F. S. M., Gall, G. M., Gadelha Jr., L. M. R., Silva, L. A. E., Siqueira, M.; 'Model-R: arcabouço escalável para modelagem de nichos ecológicos'; Data Início: 01/01/2014

Gomes, A. T. A., Bastos, B. F.; 'PortEngin: Prototipagem rápida de portais científicos para grades e nuvens computacionais'; J2EE; Prototipagem rápida de portais científicos; Data Início: 01/02/2011

Schulze, B.R., Fernandes, F. J., Mury, A. R.; 'Neblina'; LINUX; Espacos Virtuais de Trabalho para uso em Aplicacoes Cientıficas; Data Início: 01/01/2011

Gadelha Jr., L. M. R.; 'MTCProv: sistema de gerenciamento de proveniência de workflows científicos paralelos e distribuídos integrado ao Swift'; Data Início: 01/03/2010

Giraldi, G. A. , Leite, D. A. T. Q., Lira, M. H. P., de Aquino, L. C. M.; 'PyImageVis'; Data Início: 01/01/2010

Giraldi, G. A. , da Costa, L. C.; 'HPP 3D'; Windows/Linux; Estudo de modelo baseado em autômatos celulares para simulação de fluidos; NetLogo; Data Início: 01/01/2007

Giraldi, G. A. ; 'VisFluidAnimator'; PC; Animação de fluidos; Windows; Data Início: 01/10/2007

Monteiro, S. L.; 'Professora Colaboradora do Doutorado Multidisciplinar e MulltiInstitucional em Difusão do Conhecimento da UFBA'; Data Início: 02/03/2007

de Vasconcelos, A. T. R. , da Silva, R. C., Egas, G. A. V., Calfo, V. A.; 'Brazilian Microbiological Resource Center'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/04/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , de Almeida, L.G.P., Mundstein, A. S., Calfo, V. A.; 'CTPedia'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/04/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , da Silva, R. C., Calfo, V. A.; 'Eletronic Online Taxonomy of Prokaryotes'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/11/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , Egas, G. A. V., Calfo, V. A.; 'Hemophilia Brazil Project'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 02/01/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , da Silva, R. C., Calfo, V. A., Egas, G. A. V.; ' /M. hyopneumoniae/ Expression Project'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/08/2006

Giraldi, G. A. ; 'FluidSurfaceAnimator'; PC; Animação de fluxo superficial; Windows; Data Início: 01/01/2006

Giraldi, G. A. , da Costa, L. C.; 'HPP 2D'; Windows/Linux; Estudo de modelo de simulação de fluidos baseado em patículas; NetLogo; Data Início: 01/01/2006

Cunha, O L., da Silva, R. C.; 'SABIÁ-EST'; web; Ferramentas para montagem e anotação de ESTs; web; Data Início: 02/04/2005

de Vasconcelos, A. T. R. , de Almeida, L.G.P., Souza, R. C. ; 'Tractor'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/06/2004

de Vasconcelos, A. T. R. , Souza, R. C. ; 'MamMiBase'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/11/2003

de Vasconcelos, A. T. R. , de Almeida, L.G.P., Souza, R. C. , Paixão, R.F.C., Meirelles, D. B., da Silva, R. C., Cunha, O L.; 'SABIA System for Automated Bacterial Integrated Annotat'; UNIX/Apache/MYSQL; Anotação de genomas; Todos; Data Início: 02/01/2001

Total de Desenvolvimento de Softwares: 22


Outras Atividades:

Chaves, M. B. F. ; ; Tipo Atividade: Painel'Experiências Recentes de Implantação de Processo Eletrônico na Administração Pública Federal, Café com Debate Escola Nacional de Administração Pública (Enap)'; 10/10/2014

Chaves, M. B. F. ; ; Tipo Atividade: Palestra'Portal Brasileiro de Dados Abertos, 2º Encontro da Rede de Serviços de Informação ao Cidadão do Poder Executivo Federal (RedeSIC)'; 20/11/2014

Ziviani, A.; ; Tipo Atividade: Colaborador'Coordenador do Comitê Técnico em Monitoramento de Redes (CT-Mon) da RNP'; 01/03/2014

Chaves, M. B. F. ; ; Tipo Atividade: Painel'Dados Abertos, Transparência e Cidadania, Gestão em Destaque, Ministério do Planejamento, Brasília'; 08/09/2013

Chaves, M. B. F. ; ; Tipo Atividade: Painel'Planejamento Estratégico como Ferramenta Efetiva de Gestão. 1ª Jornada de Gestão Publica – Os Desafios da Gestão Publica para a Eficiência do Estado voltado ao Cidadão'; 13/03/2013

Chaves, M. B. F. ; ; Tipo Atividade: Palestra em Conselho Nacional de Secretários De Estado De Administração - CONSAD'Políticas de Atendimento ao Cidadão e Fomento aos Dados Abertos: Iniciativas de Transparência e Melhoria da Qualidade da Gestão Pública no Brasil. '; 23/11/2013

Chaves, M. B. F. ; ; Tipo Atividade: Mesa em V Congresso Internacional Software Livre e Governo Eletrônico (Consegi),'Governança, Gestão e Estratégia de TIC- Big Data: modelos e aplicações.'; 15/10/2012

Ziviani, A.; ; Tipo Atividade: Membro de Comitê'Membro do Comitê Técnico em Monitoramento de Redes (CT-Mon) da RNP'; 15/04/2011

Custodio, F. L.; ; Tipo Atividade: Desenvolvimento de Material Didático.'Tutorial para Predição de estruturas de Proteínas: Modelagem Comparativa e Ab initio.'; 01/01/2010

Custodio, F. L.; ; Tipo Atividade: Desenvolvimento de material didático.'Tutorial para prediçãi ab initio de estrutura de proteínas.'; 01/01/2008

Trindade dos Santos, M.; ; Tipo Atividade: Membro acessor'Comitê de Ética em Pesquisa - Faculdade de Medicina de Petrópolis'; 01/12/2008

Giraldi, G. A. ; ; Tipo Atividade: Elaboração de Projeto para Edital Universal, CNPq, 2009'Projeto de Pesquisa: Registro, Segmentação e Classificação de Imagens de Tomografias e Raio-X da Região Maxilo-Facial'; 01/06/2007

Monteiro, S. L.; ; Tipo Atividade: professor colaborador das disciplinas: `Conexionismo vs Simbolismo´ , ´Sistemas para Representação do Conhecimento´'Doutorado em Modelagem Computacional da Difusão do Conhecimento (UFBA/LNCC/UFABC/UEFS)'; 06/08/2007

Apolinario Jr., A. L., Giraldi, G. A. , Silva, R.L.S.; ; Tipo Atividade: Elaboração de projeto para o Edital Universal, CNPq, 2009'Projeto de Pesquisa: Aplicações de Realidade Aumentada para Bioengenharia Craniofacial'; 01/01/2006

Tanajura, C.A.S.; ; Tipo Atividade: Palestra'Palestra no IO/USP: Métodos de assimilação de dados oceanográficos e aplicações no Oceano Atlântico tropical'; 01/05/2006

de Oliveira, J. C.; ; Tipo Atividade: Elaboração de Projeto'ACAmPE - Ambiente Colaborativo para a Área de Petróleo'; 01/08/2005

de Oliveira, J. C.; ; Tipo Atividade: Elaboração de Projeto'ACOMETE - Ambientes COlaborativos para Medicina e TrEinamento'; 01/08/2005

de Oliveira, J. C.; ; Tipo Atividade: Elaboração de Projeto'Ambientes Virtuais Colaborativos Massivos'; 01/12/2004

Total de Outras Atividades: 18


ORIENTAÇÕES

Teses de Doutorado em Andamento:

Orientador(es): Silva, R. S. ; Orientado: Anderson Fernandes Pereira dos Santos; 'Desenvolvimento de Modelos de Desempemho Algebricos para Aplicacoes de Dinamica dos Fluidos Computacionais'; Data Início: 01/01/2003

Orientador(es): Corrêa, G. O. ; Orientado: Loreci Zanardini; 'Problemas de Controle Robusto em canais de Irrigação'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 05/03/2002

Orientador(es): Galeão, A. C. N. R. ; Orientado: Flávio Pietrobon Costa; 'Acoplamento de Escoamentos em rede Superficial e Subsuperficial'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2004

Orientador(es): Toledo, E. M. ; Orientado: Luciana Santos da Silva; 'Estudo de modelos para simulção de escoamentos com fronteira livre'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2006

Orientador(es): Tanajura, C.A.S.; Orientado: Jean Felix de Oliveira; 'Um Método de Assimilação de Dados para Previsão oceanográfica ao Largo da Costa Sudeste do Brasil, utilizando o Modelo Oceânico HYCOM'; Data Início: 01/03/2004

Orientador(es): Silva, R. S. ; Orientado: Eduardo Henrique da Rocha Coppoli; 'O Método de Elementos Finitos Aplicado ao Eletromagnetismo e Considerações e Motivações do Uso de um Método Sem Malha (Meshless) para Problemas desta Natureza'; Data Início: 01/03/2004

Orientador(es): Tanajura, C.A.S., Dias, P. L. S., Goncalves, L. G.; Orientado: Claudia Adam Ramos; 'Desenvolvimento de Métodos de Assimilação de Dados de Umidade do Solo e Aplicações em Modelos Acoplados Atmosfera-Biosfera sobre o Semi-Árido do Nordeste do Brasil'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 03/04/2007

Orientador(es): Monteiro-Vitorello, C. B. ; Orientado: Marcelo Marques Zerillo; 'Análise comparativa e funcional dos genomas de Leifsonia xyli subsp. xyli e Leifsonia xyli subsp. cynodontis.'; Universidade de São Paulo, USP; Data Início: 01/03/2004

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Fabíola Marques de Carvalho; 'Comparação genômica entre bactérias simbióticas diazotróficas e bactérias patogênicas relacionadas filogeneticamente'; Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/08/2006

Orientador(es): Toledo, E. M. ; Orientado: Paulo César Ferreira; 'Análise mecânica não linear de tecidos cardiácos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2008

Orientador(es): Bevilacqua, L. , Galeão, A. C. N. R. ; Orientado: Simone de Almeida Delphim; 'Modelos Bio-Econômicos de Invasão Biológica'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 28/03/2007

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Adílson Vicente Xavier; 'Desenvolvimento de Operadores de Movimento Local para Algoritmos Genéticos Aplicados à Predição ab initio de Estruturas de Proteínas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/01/2008

Orientador(es): Esquef, P. A. A., Dias, P. L. S.; Orientado: de Mattos, R. A.; '(Tese não defendida devido ao desligamento do aluno do programa) Exploração de Sinais em Interações Multiescala no Acoplamento Oceano-Atmosfera'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 15/03/2011

Orientador(es): Nicolás, M. F.; Orientado: Guedes, F. A. F.; 'Bioinformática aplicada à analise comparativa de identificação de alternative splicing em plantas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 03/03/2011

Orientador(es): Nicolás, M. F.; Orientado: Saji, G. R. Q.; 'Bioinformática aplicada à análise de transcriptoma de procarioto'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 03/03/2011

Orientador(es): Porto, F.A.M., de Macedo, J. A. F.; Orientado: Vinicius Pires de Moura Freire; 'Gerência de Grandes dados Ligados'; Universidade Federal do Ceará, UFC, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2011

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Cecília Coimbra Klein; 'Estudo Bioinformático do diálogo metabólico entre um tripanosomatídeo não patogênico e seu endosimbionte com objetivos evolutivos e funcionais'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Université Claude Bernard - Lyon I; Data Início: 01/08/2010

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Daiane Cristina Cabral Ferreira; 'Transcriptoma usando sequenciamento em larga escala em células epiteliais tímicas após silenciamento do gene CD49f e ensaios funcionais'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Federal do Rio de Janeiro - Instituto de Biologia; Data Início: 01/03/2008

Orientador(es): Schulze, B.R.; Orientado: Ferro, M.; 'Definição e Avaliação de Sistemas de Computação Científica Distribuída de Alto Desempenho em Apoio a Pesquisa'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2011

Orientador(es): Porto, F.A.M.; Orientado: Zorrilla, R. ́.; 'Tratamento de Incerteza em dados de predição '; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2013

Orientador(es): Madureira, A.L.; Orientado: Fernandes, D. A.; 'Modelagem Computacional Multiescala Neuronal'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 03/03/2012

Orientador(es): Baczynski, J. ; Orientado: da Silva, A. J.; ' Pricing and Hedging Interest Rate Derivatives in the CIR and the Sonderman models via a Finite Di fference Method '; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2015

Orientador(es): Baczynski, J. ; Orientado: Rosalino Jr., E.; 'REPRESENTAÇÕES DIFERENCIAIS FRACAS PARA FUNCIONAIS DE LÉVY'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2013

Orientador(es): Baczynski, J. ; Orientado: Rodrigues, J. B.; 'The Fourrier Approach in Pricing and Hedging Interest Rate Derivatives'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2013

Orientador(es): Custodio, F. L.; Orientado: Rocha, G. K.; 'Predição ab initio de estruturas de Proteínas utilizando aminoácidos miodificados'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 04/02/2012

Orientador(es): Custodio, F. L.; Orientado: Tavara, E. G. M.; 'Filtragem de decoys para predição de estruturas de proteínas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, PUC-Rio; Data Início: 03/02/2014

Orientador(es): Murad, M. A. ; Orientado: Lopes, T. V.; 'Simulação Numérica de Escoamentos Multifásicos em Shale Gas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 31/01/2014

Orientador(es): Murad, M. A. ; Orientado: da Rocha, A. C.; 'Termodinâmica de Gases em Meios Porosos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 31/01/2014

Orientador(es): Murad, M. A. ; Orientado: Barroso, J. S.; 'Simulação Numérica de Acoplamento Matriz/Fratura'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 31/01/2014

Orientador(es): Murad, M. A. ; Orientado: Pereira, P. A.; 'Modelagem Computacional Multiescala de Resrvatórios não Convencionais de Gases em Folhelhos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 30/06/2013

Orientador(es): Murad, M. A. ; Orientado: Radtke, L. C.; 'Modelos Hidro-Geomecânicos para Simulação de Escoamentos Multifásicos no Pré-Sal'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 30/06/2011

Orientador(es): Blanco, P. J., Feijóo, R. A.; Orientado: Rocha, F. F.; 'Modelagem Multiescala de Mecanismos de Falha em Tecidos Biológicos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2015

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Filisbino, T. A.; 'MULTI-CLASS DISCRIMINANT ANALYSIS BASED ON ENSEMBLES FOR RANKING PRINCIPAL COMPONENTS'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Centro Universitário da FEI ; Data Início: 01/03/2015

Orientador(es): Porto, F.A.M.; Orientado: Souto, Y. M.; 'GERENCIANDO MODELOS COMO SERIES ESPAÇO-TEMPORAIS INCERTAS'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2015

Orientador(es): Barreto, A.M.S., Todorov, M. G.; Orientado: Beirigo, R. L.; 'New Results on Reinforcement Learning and Optimal Control'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2015

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Werdt, P. R. T.; 'Algoritmos Evolutivos Paralelos para Predição de Estruturas de Proteínas.'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 05/05/2014

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: dos Santos, K. B.; 'Docking Proteina-Proteina.'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 04/08/2014

Orientador(es): Esquef, P. A. A.; Orientado: Martins, M. B.; 'Análise tempo-frequência de distúrbios de energia (Provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 25/05/2016

Orientador(es): Gomes, A. T. A., Valentin, F.; Orientado: Zillmer, F.; 'Implementação e paralelização de métodos de elementos finitos multiescala: aplicações no sistema cardiovascular humano (Título Provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/02/2014

Orientador(es): Valentin, F., Gomes, A. T. A.; Orientado: Pereira, W. S.; 'Metodos de Elementos Finitios Multi-Escalas para Problemas de Ondas Elásticas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/02/2015

Orientador(es): Barreto, A.M.S., Ziviani, A.; Orientado: de Mendonça, M. R. F.; 'Aprendizagem de Máquina e Redes Complexas (título provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 23/09/2016

Orientador(es): Fragoso, M. D. ; Orientado: Verges, F. V.; 'Optimal Finite Dimensional Linear Mean Square Filter for Continuous-Time Markovian Jump Linear Systems'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2017

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , Ocaña, K. A. S. O., Arge, L. W. P.; Orientado: Martins, Y. C.; 'Predição de fatores causadores dos tipos de câncer infantil a partir de vias metabólicas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 12/06/2017

Orientador(es): Ziviani, A.; Orientado: da Silva, D. N. R.; 'Redes complexas dinâmicas (título provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2017

Orientador(es): Loula, A. F. D., Borges, F.; Orientado: Belleza, M. P.; ' Algoritmos Criptográficos com p-ádicos (Provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/01/2018

Total de Teses de Doutorado em Andamento: 45


Dissertações de Mestrado em Andamento:

Orientador(es): Raupp, F. M. P. ; Orientado: Cristiane Dias; 'Otimização linear'; Data Início: 01/01/2004

Orientador(es): Fernandez, J. H.; Orientado: Monika Aparecida Coronado; 'Dinamica da interação de ADAMs com integrinas'; Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Laboratório Nacional de Luz Sincrotron, LNLS; Data Início: 01/03/2006

Orientador(es): Borges, C. C. H. , Ebecken, N. F. F.; Orientado: André Mello; 'Uma estratégia de filtragem Aplicada na Seleção de Características em Problemas de Classificação'; COPPE-UFRJ-Programa de Engenharia Civil, PEC-COPPE; Data Início: 01/07/2006

Orientador(es): Garcia, E. L. M. ; Orientado: Patricia Costa; 'Programacao Multithreading para Computação de Alto Desempemnho de Programas de Elementos Finitos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2006

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , Thompson, F.; Orientado: Ana Cristina Gomes Silveira; 'Desenvolvimento de Uma Ferramenta para a Predição de Small RNAs em Vibrio'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Federal do Rio de Janeiro - Instituto de Biologia; Data Início: 11/03/2008

Orientador(es): Borges, C. C. H. , da Silva, J. C. P.; Orientado: Maria Fernanda Barbosa Wanderley; ' Algoritmos Genéticos no Problema de Regulação Gênica '; Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ; Data Início: 01/08/2007

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Luíz Zacarias do Amaral; 'Utilização de Técnicas de Reconhecimentos de Padrões para a Previsão de Constantes de Inibição Recptor-Ligante'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2009

Orientador(es): Cintia Coelho; Orientado: Medeiros, J. D.; 'Análise da diversidade genética e função da comunidade microbiana das águas do Córrego São Pedro, comparando duas regiões com diferentes níveis de urbanização'; Universidade Federal de Juiz de Fora, UFJF; Data Início: 03/03/2011

Orientador(es): Nicolás, M. F.; Orientado: Ramos, P. I. P.; 'Análise Genômica Comparativa e Reconstrução Metabólica de Klebsiella pneumoniae Kp13'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 03/03/2010

Orientador(es): Nicolás, M. F., Figueiredo, A. M. S.; Orientado: Costa, M. O. C. E.; 'Genômica comparativa de variantes de Staphylococcus aureus MRSA com diferentes padrões de biofilme isolados no Brasil'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 03/03/2010

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Godinho, C. P. S.; 'Pequenos RNAs em mycoplasmas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2012

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Ribeiro, M. I.; 'Classificação baseada em composição de reads metagenômicos por meio de máquinas de vetores de suporte'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2011

Orientador(es): Schulze, B.R., Pinto, R. C. G.; Orientado: Laion Luiz Fachini Manfroi; 'Virtualização de GPUs em Nuvem Computacional Privada'; Instituto Militar de Engenharia, IME, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/02/2012

Orientador(es): Almeida, R. C. ; Orientado: de Resende, A. C. M.; 'Modelagem e Simulação de Problemas de Crescimento Tumoral'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 31/01/2014

Orientador(es): Almeida, R. C. ; Orientado: da Rocha, H. L.; 'Modelagem Discreta do Crescimento Tumoral'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 31/01/2014

Orientador(es): Almeida, R. C. ; Orientado: Fabian, J. H. L.; 'Calibração e Validação de Modelos de Crescimento Tumoral.'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 31/01/2014

Orientador(es): Barreto, A.M.S.; Orientado: Sarmiento, E. M.; 'Deep Kernel Machines'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2015

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Pereira, F. S. S.; 'Funções empíricas de afinidade proteína-ligante para triagem virtual em larga escala.'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 09/03/2015

Orientador(es): Ocaña, K. A. S. O., Mattoso, M. L. Q.; Orientado: Silvia Benza Bareiro; 'Monitoramento de Workflows Científicos de Bioinformática em Nuvens Computacionais'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Federal do Rio de Janeiro - Programa de Engenharia de Sistemas e Computação, Coppe/Sistemas; Data Início: 01/01/2014

Orientador(es): Ziviani, A., Esquef, P. A. A., Vieira, A. B.; Orientado: Carnivali, G. S.; 'Comparabilidade de Grafos de Larga-Escala (título provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2017

Orientador(es): Ziviani, A.; Orientado: Fantecele, H. C.; 'Ciência de Redes (título provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/05/2017

Orientador(es): Ocaña, K. A. S. O., de Oliveira, D. C. M.; Orientado: Thaylon Guedes; 'Workflows para ambientes HPC'; Universidade Federal Fluminense, UFF, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 20/07/2016

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Ramos, E. M.; 'Aplicacoes de Tecnicas de Aprendizagem Profunda para Processamento e Classificação de Imagens Aéreas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, INSTITUTO CHICO MENDES DE CONSERVAÇÃO DA BIODIVERSIDADE, ICMBio; Data Início: 01/09/2017

Orientador(es): Nicolás, M. F., Ramos, P. I. P.; Orientado: Colpo, R. A.; 'Reconstrução metabólica autómatica e de precisão utilizando ferramenta de gap filling baseada em dados experimentais de crescimento celular e de essencialidade gênica'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/06/2016

Orientador(es): Nicolás, M. F.; Orientado: Barbosa, J. S. C.; 'Modelagem de redes regulatórias em isolados clinicos de bactérias patogênicas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/06/2017

Orientador(es): Borges, F., PORTUGAL, R.; Orientado: Silva, M. A.; ' Algoritmos Criptográficos Pós-Quânticos (Provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/01/2018

Total de Dissertações de Mestrado em Andamento: 26


Monografias de Conclusão do Curso de Aperfeiçoamento:

Orientador(es): Osthoff, C. ; Orientado: Cristiane dos Santos Oliveira; 'Desenvolvimento de uma plataforma de Grade Computacional para aplicações de Sensoriamento Remoto'; 01/04/2003

Total de Monografias de Conclusão do Curso de Aperfeiçoamento: 1


Trabalhos de Conclusão de Curso de Graduação:

Orientador(es): Almeida, R.A.; Orientado: Bruno Jorge Iost Theobald e Jonathan da Silva Mantino Rodrigues; 'Implantação do Sistema Service Desk: Estudo de Caso para a Prefeitura de Petrópolis'; Universidade Estácio de Sá - Petrópolis, RJ; 02/02/2010

Orientador(es): Giraldi, G. A. , Silva, R.L.S.; Orientado: João Vicente Reis; 'Animação de Fluidos usando SPH e Rendering Baseado em Modelos Físicos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Estácio de Sá - Petrópolis, RJ; 09/06/2009

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Victor Vescovini; 'Representacao Tensorial para Imagens Digitais, Reducao de Dimensinalidade e Reconstrucao'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/08/2008

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Diego Leite; 'Segmentação e Visualização de imagens Radiológicas em Odontologia'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/08/2008

Orientador(es): ; Raupp, A.C.; Orientado: Marcos Vinicius Vilaça; 'Popularização do Computador na Sociedade'; 01/01/2008

Orientador(es): Raupp, A.C.; Orientado: Elen da Silva Dias de Oliveira / André Padua dos Santos; 'Exclusão e Inclusão digital no Século XXI'; Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/02/2007

Orientador(es): Apolinario Jr., A. L.; Orientado: Marcelo Monteiro Galheigo; 'Um Modelo Digital de Terreno baseado em Triangulações Regulares Adaptativas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/11/2004

Total de Trabalhos de Conclusão de Curso de Graduação: 7


Iniciação Científica:

Orientador(es): Todorov, M. G.; Orientado: Junior do Nascimento Xavier; 'Modelagem e Controle de um Manipulador Robótico Sujeito a Falhas'; 05/03/2018

Orientador(es): Giraldi, G. A. , Lopes, F. J. P.; Orientado: MATHEUS ALVES DE MOURA; 'Análise e Processamento de Imagens de Microscopia Confocal'; Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/07/2017

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Alexandra Miguel Raibolt da Silva; 'Reconhecimento de Padroes e Analise de Imagens via Redes Neurais'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, FAETERJ Petrópolis, FAETERJ Petrópol; 01/08/2017

Orientador(es): Marcelo Dutra Fragoso; Orientado: Guedes, H. R.; 'Localização de Robôs via Filtro de Kalman'; 01/07/2017

Orientador(es): Ocaña, K. A. S. O.; Orientado: Joice Cristina Alves Gouveia Pedro ; 'Explorando Sistemas de Gerência de Workflows Científicos para Experimentos de Bioinformática em Ambientes HPC'; 01/01/2017

Orientador(es): Ocaña, K. A. S. O., Gadelha Jr., L. M. R.; Orientado: Albuquerque, M. M. R.; 'Gerenciamento e Análise de Dados da Biodiversidade Marinha Brasileira'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/01/2016

Orientador(es): Ocaña, K. A. S. O., Gadelha Jr., L. M. R.; Orientado: de Souza, M. T.; 'Aplicações de Técnicas de Aprendizagem de Máquina à Análise de Dados de Domínio e de Tempo de Execução de Workflows de Bioinformática'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/01/2016

Orientador(es): Ocaña, K. A. S. O., Gadelha Jr., L. M. R.; Orientado: de Souza, M. T.; 'Aplicações de Técnicas de Aprendizagem de Máquina à Análise de Dados de Domínio e de Tempo de Execução de Workflows de Bioinformática'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/01/2016

Orientador(es): Ocaña, K. A. S. O., Gadelha Jr., L. M. R.; Orientado: Albuquerque, M. M. R.; 'Gerenciamento e Análise de Dados da Biodiversidade Marinha Brasileira'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/01/2016

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , Thompson, C. E.; Orientado: Artur Duque Rossi; 'Aspectos evolutivos e estruturais de proteínas de bactérias patogênicas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Católica de Petrópolis, UCP; 01/03/2011

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , Thompson, C. E.; Orientado: Rafael Nicolay Baptista da Silva; 'Evolução molecular de proteínas bacterianas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Católica de Petrópolis, UCP; 01/03/2011

Orientador(es): de Oliveira, J. C., dos Santos, S. R.; Orientado: Rivaldo Rodrigues Machado Junior; 'Controle Dinâmico de Camera em Ambientes Virtuais de Mesa para Ampliar Imersão'; Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/08/2008

Orientador(es): Almeida, R. C. ; Orientado: Rodolfo Honorato de Mello Luz; 'Métodos Numéricos'; 01/08/2007

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Karina Batista; 'CONSTRUÇÃO DE BIBLIOTECAS DE FRAGMENTOS PARA A PREDIÇÃO DE ESTRUTURAS DE PROTEÍNAS'; 01/08/2007

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Damásio Antônio Alves Ferreira; 'Desenvolvimento do Portal MHOLline: Sistema Computacional para Modelagem Comparativa em Genômica Estrutural'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/09/2006

Orientador(es): Kritz, M. V. , Trindade dos Santos, M., Rodrigues, P.S.S.; Orientado: Liliane Paiva de Souza; 'Implementação de uma Estrutura de Dados para Grafos Todo-parte'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 18/08/2006

Orientador(es): Tanajura, C.A.S.; Orientado: Hans Castro Einsiedler; 'Construção de Análise Regional do Modelo Atmosférico WRF sobre o Nordeste do Brasil com o Método de Assimilação de Dados 3D-VAR'; Universidade Federal da Bahia, UFBA; 01/03/2006

Orientador(es): Tanajura, C.A.S.; Orientado: Jonatas Castro Einsiedler; 'Investigação da Previsibilidade de Tempo do Modelo Atmosférico WRF sobre o Nordeste do Brasil'; Universidade Federal da Bahia, UFBA; 01/03/2006

Orientador(es): Trindade dos Santos, M.; Orientado: Liliane Paiva de Souza; 'Implementação computacional de grafos todo-parte'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/02/2006

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , da Silva, J. C. P.; Orientado: Glauber Marcius Cardoso Menezes; 'Aplicalção de Linguagens Formais ao Problema de Regulação Gênica'; Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/03/2005

Orientador(es): Kritz, M. V. ; Orientado: Simone de Almeida Pinto; 'Especificação de um modelo epidemiológico em UML'; 01/03/2004

Orientador(es): Rodrigues, P.S.S.; Orientado: Bruno de Souza P. M. Correa; 'WEB SEARCH IMAGE MACHINE'; 01/03/2004

Total de Iniciação Científica: 22


Orientação ao Pós Doutorado:

Orientador(es): Fragoso, M. D. ; Orientado: Telles Timóteo da Silva; 'Modelos de Fleming-Viot versus Difusão com "resseting"'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 12/02/2018

Orientador(es): Fragoso, M. D. , Todorov, M. G.; Orientado: Rodrigues, C. C. G.; 'Control and Filtering for Continuous-Time Markov Jump Linear Systems with Partial Mode Information'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 11/04/2017

Orientador(es): Fragoso, M. D. , Todorov, M. G.; Orientado: Rodrigues, C. C. G.; 'Control and Filtering for Continuous-Time Markov Jump Linear Systems with Partial Mode Information'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 11/04/2017

Orientador(es): Ziviani, A.; Orientado: Abrahão, F. S.; 'Redes Algorítmicas e Ciência de Redes'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/11/2016

Orientador(es): Ziviani, A.; Orientado: Wehmuth, K.; 'Representação, Algoritmos e Aprendizado de Máquina em Redes Complexas de Alta Ordem'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/09/2016

Orientador(es): Ziviani, A.; Orientado: Abrahão, F. S.; 'Redes Algorítmicas e Ciência de Redes'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/11/2016

Orientador(es): Ziviani, A.; Orientado: Wehmuth, K.; 'Representação, Algoritmos e Aprendizado de Máquina em Redes Complexas de Alta Ordem'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/09/2016

Orientador(es): Fragoso, M. D. , Todorov, M. G.; Orientado: Jose Cristiano Pereira; 'Análise Probabilística de Risco em Motores de Aeronave'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, GE Aviation, GE Aviation; 01/06/2015

Orientador(es): Coutinho, D., de Souza, C. E.; Orientado: Maestrelli, R.; ' Análise de Estabilidade, Estimação de Estados e Síntese de Controladores para Sistemas de Controle por Rede'; Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC; 01/03/2011

Orientador(es): Coutinho, D., de Souza, C. E.; Orientado: Maestrelli, R.; ' Análise de Estabilidade, Estimação de Estados e Síntese de Controladores para Sistemas de Controle por Rede'; Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC; 01/03/2011

Orientador(es): Schulze, B.R.; Orientado: Antonio Roberto Mury; 'Escalonamento de Recursos em Ambientes Virtuais de Trabalho Nuvens e Grades Computacionais'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/05/2011

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Camila Silva de Magalhães; 'Desenho Racional de Novos Inibidores de Aspartil Proteases para o Tratamento da Malária: Desenvolvimento de Metodologias de “Docking” e Aplicações '; Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/10/2009

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Julio Santiago Espinoza Ortiz; 'Modelagem de Tecidos Humanos via Modelos Computacionais Baseados em Métodos da Física Matemática'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/11/2005

Total de Orientação ao Pós Doutorado: 13


Bolsistas em Projetos de Pesquisa:

Orientador(es): Souto, R. P., Gomes, A. T. A.; Orientado: Mateus Silva de Melo; 'Metodologia de auditoria de código e planejamento de otimização aplicada em método de elementos finitos multi-escala'; 01/07/2018

Orientador(es): Souto, R. P.; Orientado: Maria Eugênia Sausen Welter; 'Otimização computacional do módulo da química na atmosfera no modelo numérico de previsão de tempo BRAMS'; 01/05/2017

Orientador(es): Raupp, A.C.; Orientado: Ana Paula Santos e Santos ; 'Projeto de Ampliação e Aprimoramento de Serviços da Incubadora LNCC'; Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro, FAPERJ, Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/10/2009

Orientador(es): Raupp, A.C.; Orientado: Igor Pires dos Santos Fernandes; 'Projeto de Ampliação e Aprimoramento de Serviços da Incubadora LNCC 2 '; Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro, FAPERJ, Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/10/2009

Orientador(es): de Oliveira, J. C.; Orientado: Daniel Ribeiro Chelles; 'Modelagem Geométrica de Objetos 3D'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/12/2006

Total de Bolsistas em Projetos de Pesquisa: 5



PRODUÇÃO TÉCNICA

ATIVIDADES TÉCNICAS

Outras Atividades Técnicas:

Esquef, P. A. A.; 'Editoração de vídeo-aulas do curso GA-038 Processamento Digital de Sinais (4T16) https://www.youtube.com/channel/UCmBzWAiJjswKbQG473joL_g'; 16/09/2016; LNCC - Petrópolis/RJ

Fragoso, M. D. ; 'AssessorTécnico da FAPESP'; 01/07/2009

Porto, E. M. ; 'Tratamento estatístico de dados meteorológicos '; 01/04/2006; LNCC - Petrópolis/RJ

Total de Outras Atividades Técnicas: 3


SERVIÇOS TÉCNICOS

Serviços Técnicos:

Gadelha Jr., L. M. R., Goncalves, L. R. O.; 'Gerência da Autoridade Certificadora do LNCC (AC LNCC)'; Data: 25/02/2010

Romano, N. F. R. , Santos, S.A.O., Marci Jr., N. E. S; 'Manutenção de equipamentos de Informática'; Data: 01/09/2003

Romano, N. F. R. , Alves, E.O., Silveira, A.C.G., Pereira, A.G., Neves, L. A. P., Gadelha Jr., L. M. R., Abreu, R. A. ; 'Serviço de Sistemas'; Data: 01/09/2003

Total de Serviços Técnicos: 3


DESENVOLVIMENTO DE SOFTWARES E SISTEMAS COMPUTACIONAIS

Softwares:

Murad, M. A. , Garcia, E. L. M. , Pereira, P. A., Lopes, T. V.; 'Multiscale Shale Gas Simulator - MSShaleGaS'; Data: 09/12/2016

Dardenne, L. E. , Guedes, I. A., da Silva, E. K., de Magalhães, C. S., Almeida, D. M., Barbosa, H. J. C.; 'Portal web DockThor'; www.dockthor.lncc.br; Data: 01/06/2013

Giraldi, G. A. , Leite, D. A. T. Q., Lira, M. H. P., de Aquino, L. C. M.; 'PyImageVis.'; Data: 01/01/2010

Dardenne, L. E. , Custodio, F. L., Linden, M. G. V. D., Barbosa, H. J. C.; 'GAPF NMR - Genetic Algorithm for Protein Folding using RMN restraints'; Linux - C++; Programa para predição de eestruturas 3D de proteínas utilizndo dados experimentais de RMN; Linux; Data: 01/03/2007

Feijóo, R. A., Blanco, P. J.; 'HeMoLab 1.0 Beta'; Linux, Windows; Modelagem e Simulação Computacional do Sistema Cardiovascular Humano; Data: 01/01/2006

Furtado, C. B., Goliatt, P. V. Z. C., Dardenne, L. E. ; 'LLDB - LASSBio Ligand Data Bank'; LINUX; Gerenciar o Banco de ligantes do LASSBio/Fac. Farmácia/UFRJ; WEB Restrito; Data: 01/01/2005

Valentim, I. A., Pereira, D. C., Dumas, D. D.; 'Desenvolvimento da Home Page Dinâmica do LNCC'; WEB; Linux; Data: 01/06/2001

Valentim, I. A., Pereira, D. C., Dumas, D. D., Ciccimarra, G., Barroso, G.N.; 'Desenvolvimento da INTRANET do LNCC'; WEB; Linux; Data: 01/06/2001

Total de Softwares: 8


OUTROS TIPOS DE PRODUÇÃO TÉCNICA

Outros Tipos de Produção Técnica:

Almeida, R.A.; 'Presidente da Comissão de Julgamento para apreciação dos Projetos de Apoio à Implantação e Modernização dos Centros Vocacionais Tecnológicos no Estado do Rio de Janeiro'; Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro, FAPERJ; LNCC - Petrópolis/RJ; 01/08/2006

Total de Outros Tipos de Produção Técnica: 1